الذرّة التائهة هي ذلك الإنسان الضعيف التائه في ظلمات هذا الكون الكبير، والذي سيظلّ تائها حتى يعرف ربّه حقّ المعرفة، ويفهم معنى وجوده، وحقيقة هذا العالم والعالم الآخر. يأخذك الكتاب بأسلوب يمزج بين الفكر والأدب في جولةٍ من التأمّلات الفكرية التي تبدأ بالكون الكبير، وتمرّ ببعض مشاهد الطبيعة وظاهرة الحياة، ثم يتوقّف طويلا متأمّلا مختلفَ جوانب الطبيعة الإنسانية المتفرّدة، والتي تنطق بالإيمان في كل مشهدٍ منها، ليصل في نهاية الكتاب إلى تدبّر بعض دلائل القرآن الكريم التي تشهد بأنّه لا يمكن أن يصدر عن بشرٍ، بل هو كلام الله الحكيم خالق الإنسان والعالم. والكتاب وإنْ كان يمثّل تجربة فكرية ذاتية للكاتب، ولكنّه يخاطب العقول والقلوب في آنٍ معًا، وهو يقدّم هذه التجربة الذاتية والرحلة الفكرية للباحثين عن الله واليقين ولفاقدي الإيمان وللمتشكّكين على حدّ سواء، داعيًا إيّاهم إلى التفكّر في الدلالات الإيمانية الكثيفة والمتنوعة التي يبثّها العالم والإنسان والقرآن، وإلى التداوي من ألم خواء هذا العالم من المعنى والغاية والمصير اللائق بالإنسان.